Programme
mercredi 13 décembre 2017
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événement |
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09:30 - 10:20
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Accueil - Café (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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10:20 - 10:30
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Introduction (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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10:30 - 12:50
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Microbiologie, Biodiversité & Métabolisme (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 10:30 - 11:25 |
› Unexpected functional traits of ammonia-oxidizing Thaumarchaea - Michael Wagner, Department of Microbiology and Ecosystem Science, University of Vienna |
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| 11:25 - 11:50 |
› Why favouring ammonia oxidising archaea could mitigate soil nitrous oxide emissions - Linda Hink, École Centrale de Lyon |
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| 11:50 - 12:15 |
› The uniqueness of archaeal ammonia oxidisers: insights from genomic and physiological analyses - Graeme Nicol, École Centrale de Lyon |
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| 12:15 - 12:40 |
› L´astuce moléculaire des méthanogènes pour fixer le CO2 sans consommer de l´ATP - Tristan Wagner, Max-Planck-Institut for terrestrial microbiology |
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| 12:40 - 12:50 |
› New attempts for in vivo analysis of infected cells by ATV virus - Soizick LUCAS-STAAT, Institut Pasteur |
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12:50 - 14:30
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Déjeuner (Restaurant du CNRS) |
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14:30 - 15:55
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Microbiologie, Biodiversité & Métabolisme (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 14:30 - 14:55 |
› Impact of temperature on soil archaeal diversity and lipidome - Sylvie Collin, Université Pierre et Marie Curie |
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| 14:55 - 15:20 |
› Biodiversité électrogène et électrosynthèse microbienne hyperthermophiles issus de source hydrothermale profonde - Guillaume PILLOT, Institut Méditerranéen d'Océanologie |
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| 15:20 - 15:30 |
› Development of culturomics and DNA metabarcoding for prokaryotic microbiota characterization: application to Archaea and Bacteria of agronomical interest encountered in the rice rhizosphere of Camargue. - Isabelle PIERETTI, CIRAD - Equipe MicroQuar- Unité de biologie et génétique des interactions plante-parasite |
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| 15:30 - 15:55 |
› Ultrastructure of an archaeal membrane containing apolar structural lipids - Marta Salvador Castell, Microbiologie, adaptation et pathogénie |
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15:55 - 16:30
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Pause café |
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16:30 - 18:15
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Thermococcales (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 16:30 - 16:55 |
› Insights into the Thermococcales membrane architecture: clarifications on their core lipid compositions - Maxime Tourte, Microbiologie, adaptation et pathogénie |
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| 16:55 - 17:05 |
› Genomic diversity of closely related Thermococcus populations in deep-sea hydrothermal vent context - Karine Alain, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes |
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| 17:05 - 17:15 |
› Looking for organic substrate degradation pathways in Thermococcales - Jordan Hartunians, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes |
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| 17:15 - 17:40 |
› H2-dependent formate production by hyperthermophilic Thermococcales - Sébastien LE GUELLEC, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmes |
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| 17:40 - 18:05 |
› Hot Sex: A self-transmissible plasmid isolated from a hyperthermophilic Thermococcus species - Ryan Catchpole, Biologie Moléculaire du Gène chez les Extrêmophiles, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule |
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| 18:05 - 18:15 |
› Interactomics with AP/MS : an update to reach identification of macromolecular complexes - Sébastien Laurent, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes |
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| Heures |
événement |
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08:30 - 10:10
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Thermococcales (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 08:30 - 08:55 |
› 100+ Thermococcales genomes: progress report - Jacques Oberto, Institute for Integrative Biology of the Cell |
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| 08:55 - 09:20 |
› Thermococcales as model organisms to explore the physics of molecular adaptation to high-hydrostatic pressure and temperature - Phil Oger, Microbiologie, adaptation et pathogénie |
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| 09:20 - 09:45 |
› Transcriptomics reveal a fine-tuning adaptation to pressure in the piezophile Thermococcus piezophilus - Yann Moalic, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes [Plouzané] |
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| 09:45 - 10:10 |
› The lysine acetylome of the radioresistant archaeon Thermococcus gammatolerans - Fabrice Confalonieri, Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC) |
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10:10 - 10:50
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Pause café |
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10:50 - 12:50
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Thermococcales (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 10:50 - 11:15 |
› Integrases of plasmids and viruses of Thermococcales: site-specific and homologous recombination - Catherine BADEL, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule |
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| 11:15 - 11:25 |
› Production of nanotubes by Thermococcus 15-2: Intercellular connection - Emilie Gauliard, Biologie Cellulaire des Archées |
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| 11:25 - 11:50 |
› Phylogenomic analysis with signatures of archaeal Ski2-like helicases. - Petra Langendijk-Genevaux, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires |
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| 11:50 - 12:15 |
› ZY3, a new partner of the proteasome machinery in Thermococcales: regulator or adaptor protein ? - Gaëlle Hogrel, Institut de Biologie Structurale |
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| 12:15 - 12:40 |
› Towards the identification of archaeal β-CASP ribonuclease and Ski2-like helicase complexes in Pyrococcus abyssi - Duy Khanh PHUNG, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires |
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| 12:40 - 12:50 |
› Mise au point d'un vecteur réplicatif chez Thermococcus barophilus - Rémi Dulermo, Institut Français de Recherche pour lÉxploitation de la Mer, Université de Brest, Centre National de la Recherche Scientifique |
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12:50 - 14:30
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Déjeuner (Restaurant du CNRS) |
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14:30 - 15:50
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Evolution & génomique (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 14:30 - 15:25 |
› Role of CRISPR-Cas systems in gene exchange and speciation in archaea - Uri Gophna, The George S. Wise Faculty of Life Science, Tel Aviv University |
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| 15:25 - 15:50 |
› How does the Cas1-homologous integrase of casposons recognize its target site ? - Pierre Béguin, Biologie moléculaire du Gène chez les Extrêmophiles |
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15:50 - 16:25
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Pause café |
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16:25 - 18:05
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Evolution & génomique (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 16:25 - 16:50 |
› Evolution des propriétés thermiques d'enzymes provenant des methanococcales - Dominique Madern, CNRS, Elma Group, Institut de Biologie Structurale J.-P. Ebel, CEA CNRS UJF, UMR 5075, France |
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| 16:50 - 17:15 |
› A glimpse into the evolutionary success of ammonia-oxidizing archaea - Sophie Abby, Techniques de lÍngénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] |
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| 17:15 - 17:40 |
› Etude de la position de la racine de l'arbre des archées / Study of the position of the archaeal root - Monique Aouad, Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, 69622 Villeurbanne, France. |
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| 17:40 - 18:05 |
› A talkative indel - Patrick Forterre, Institut Pasteur |
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20:00 - 23:45
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Repas de gala - Le repas de gala aura lieu à la Brasserie les Brotteaux à Lyon.
1, Place Jules Ferry 69006 Lyon (04 72 74 03 98).
Rendez-vous à partir de 20h.
https://www.brasseriedesbrotteaux.com/ |
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vendredi 15 décembre 2017
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événement |
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08:30 - 10:10
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Intégrité génomique et expression des gènes (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 08:30 - 09:25 |
› Mechanisms of Transcription - Finn Werner, University College London |
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| 09:25 - 09:35 |
› Overcoming transcription arrest - Interplay between TFS1 and RNAP subunit Rpo8 - Thomas Fouqueau, Institute of Molecular and Structural Biology, University College London |
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| 09:35 - 09:50 |
› Influence of the ratio of dNTPs/rNTPs pool on ribonucleotides incorporation during archaeal DNA synthesis - Ghislaine Henneke, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmophiles |
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| 09:50 - 10:00 |
› Efficiency and specificity of PolD and PolB proofreading activities in the edition of ribonucleotides in Pyrococcus abyssi - Mélanie Lemor, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmophiles |
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| 10:00 - 10:10 |
› Biochemical and Structural studies of the ASH-Ski2 helicase/aRNase J Ribonuclease Complex in Pyrococcus abyssi - Manon Batista, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires |
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10:10 - 10:50
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Pause café |
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10:50 - 12:30
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Intégrité génomique et expression des gènes (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes) |
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| 10:50 - 11:15 |
› Intracellular dynamics of archaeal single-stranded DNA binding protein |
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| 11:15 - 11:40 |
› Physical and functional interplay between PCNA and Mre11/Rad50 complex from Pyrococcus furiosus - Yang Lu, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes |
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| 11:40 - 12:05 |
› Making Ribosomes in Archaea - Sébastien Ferreira-Cerca, Biochemistry III - Institute for Biochemistry, Genetics and Microbiology - University Regensburg |
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| 12:05 - 12:30 |
› INTRODUCING AN OPPOSITE TWIST : CONSEQUENCE OF THE SIMULTANEOUS PRESENCE OF GYRASE AND REVERSE GYRASE ON THE ARCHAEAL CELL PHYSIOLOGY - Paul Villain, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule |
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12:30 - 14:30
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Déjeuner (Restaurant du CNRS) |
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14:30 - 17:00
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Table ronde - Prospective GdR |
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