mercredi 13 décembre 2017

Heures événement  
09:30 - 10:20 Accueil - Café (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
10:20 - 10:30 Introduction (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
10:30 - 12:50 Microbiologie, Biodiversité & Métabolisme (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
10:30 - 11:25 › Unexpected functional traits of ammonia-oxidizing Thaumarchaea - Michael Wagner, Department of Microbiology and Ecosystem Science, University of Vienna  
11:25 - 11:50 › Why favouring ammonia oxidising archaea could mitigate soil nitrous oxide emissions - Linda Hink, École Centrale de Lyon  
11:50 - 12:15 › The uniqueness of archaeal ammonia oxidisers: insights from genomic and physiological analyses - Graeme Nicol, École Centrale de Lyon  
12:15 - 12:40 › L´astuce moléculaire des méthanogènes pour fixer le CO2 sans consommer de l´ATP - Tristan Wagner, Max-Planck-Institut for terrestrial microbiology  
12:40 - 12:50 › New attempts for in vivo analysis of infected cells by ATV virus - Soizick LUCAS-STAAT, Institut Pasteur  
12:50 - 14:30 Déjeuner (Restaurant du CNRS)  
14:30 - 15:55 Microbiologie, Biodiversité & Métabolisme (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
14:30 - 14:55 › Impact of temperature on soil archaeal diversity and lipidome - Sylvie Collin, Université Pierre et Marie Curie  
14:55 - 15:20 › Biodiversité électrogène et électrosynthèse microbienne hyperthermophiles issus de source hydrothermale profonde - Guillaume PILLOT, Institut Méditerranéen d'Océanologie  
15:20 - 15:30 › Development of culturomics and DNA metabarcoding for prokaryotic microbiota characterization: application to Archaea and Bacteria of agronomical interest encountered in the rice rhizosphere of Camargue. - Isabelle PIERETTI, CIRAD - Equipe MicroQuar- Unité de biologie et génétique des interactions plante-parasite  
15:30 - 15:55 › Ultrastructure of an archaeal membrane containing apolar structural lipids - Marta Salvador Castell, Microbiologie, adaptation et pathogénie  
15:55 - 16:30 Pause café  
16:30 - 18:15 Thermococcales (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
16:30 - 16:55 › Insights into the Thermococcales membrane architecture: clarifications on their core lipid compositions - Maxime Tourte, Microbiologie, adaptation et pathogénie  
16:55 - 17:05 › Genomic diversity of closely related Thermococcus populations in deep-sea hydrothermal vent context - Karine Alain, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes  
17:05 - 17:15 › Looking for organic substrate degradation pathways in Thermococcales - Jordan Hartunians, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes  
17:15 - 17:40 › H2-dependent formate production by hyperthermophilic Thermococcales - Sébastien LE GUELLEC, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmes  
17:40 - 18:05 › Hot Sex: A self-transmissible plasmid isolated from a hyperthermophilic Thermococcus species - Ryan Catchpole, Biologie Moléculaire du Gène chez les Extrêmophiles, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule  
18:05 - 18:15 › Interactomics with AP/MS : an update to reach identification of macromolecular complexes - Sébastien Laurent, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes  

jeudi 14 décembre 2017

Heures événement  
08:30 - 10:10 Thermococcales (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
08:30 - 08:55 › 100+ Thermococcales genomes: progress report - Jacques Oberto, Institute for Integrative Biology of the Cell  
08:55 - 09:20 › Thermococcales as model organisms to explore the physics of molecular adaptation to high-hydrostatic pressure and temperature - Phil Oger, Microbiologie, adaptation et pathogénie  
09:20 - 09:45 › Transcriptomics reveal a fine-tuning adaptation to pressure in the piezophile Thermococcus piezophilus - Yann Moalic, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes [Plouzané]  
09:45 - 10:10 › The lysine acetylome of the radioresistant archaeon Thermococcus gammatolerans - Fabrice Confalonieri, Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC)  
10:10 - 10:50 Pause café  
10:50 - 12:50 Thermococcales (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
10:50 - 11:15 › Integrases of plasmids and viruses of Thermococcales: site-specific and homologous recombination - Catherine BADEL, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule  
11:15 - 11:25 › Production of nanotubes by Thermococcus 15-2: Intercellular connection - Emilie Gauliard, Biologie Cellulaire des Archées  
11:25 - 11:50 › Phylogenomic analysis with signatures of archaeal Ski2-like helicases. - Petra Langendijk-Genevaux, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires  
11:50 - 12:15 › ZY3, a new partner of the proteasome machinery in Thermococcales: regulator or adaptor protein ? - Gaëlle Hogrel, Institut de Biologie Structurale  
12:15 - 12:40 › Towards the identification of archaeal β-CASP ribonuclease and Ski2-like helicase complexes in Pyrococcus abyssi - Duy Khanh PHUNG, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires  
12:40 - 12:50 › Mise au point d'un vecteur réplicatif chez Thermococcus barophilus - Rémi Dulermo, Institut Français de Recherche pour lÉxploitation de la Mer, Université de Brest, Centre National de la Recherche Scientifique  
12:50 - 14:30 Déjeuner (Restaurant du CNRS)  
14:30 - 15:50 Evolution & génomique (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
14:30 - 15:25 › Role of CRISPR-Cas systems in gene exchange and speciation in archaea - Uri Gophna, The George S. Wise Faculty of Life Science, Tel Aviv University  
15:25 - 15:50 › How does the Cas1-homologous integrase of casposons recognize its target site ? - Pierre Béguin, Biologie moléculaire du Gène chez les Extrêmophiles  
15:50 - 16:25 Pause café  
16:25 - 18:05 Evolution & génomique (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
16:25 - 16:50 › Evolution des propriétés thermiques d'enzymes provenant des methanococcales - Dominique Madern, CNRS, Elma Group, Institut de Biologie Structurale J.-P. Ebel, CEA CNRS UJF, UMR 5075, France  
16:50 - 17:15 › A glimpse into the evolutionary success of ammonia-oxidizing archaea - Sophie Abby, Techniques de lÍngénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble]  
17:15 - 17:40 › Etude de la position de la racine de l'arbre des archées / Study of the position of the archaeal root - Monique Aouad, Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, 69622 Villeurbanne, France.  
17:40 - 18:05 › A talkative indel - Patrick Forterre, Institut Pasteur  
20:00 - 23:45 Repas de gala - Le repas de gala aura lieu à la Brasserie les Brotteaux à Lyon. 1, Place Jules Ferry 69006 Lyon (04 72 74 03 98). Rendez-vous à partir de 20h. https://www.brasseriedesbrotteaux.com/  

vendredi 15 décembre 2017

Heures événement  
08:30 - 10:10 Intégrité génomique et expression des gènes (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
08:30 - 09:25 › Mechanisms of Transcription - Finn Werner, University College London  
09:25 - 09:35 › Overcoming transcription arrest - Interplay between TFS1 and RNAP subunit Rpo8 - Thomas Fouqueau, Institute of Molecular and Structural Biology, University College London  
09:35 - 09:50 › Influence of the ratio of dNTPs/rNTPs pool on ribonucleotides incorporation during archaeal DNA synthesis - Ghislaine Henneke, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmophiles  
09:50 - 10:00 › Efficiency and specificity of PolD and PolB proofreading activities in the edition of ribonucleotides in Pyrococcus abyssi - Mélanie Lemor, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmophiles  
10:00 - 10:10 › Biochemical and Structural studies of the ASH-Ski2 helicase/aRNase J Ribonuclease Complex in Pyrococcus abyssi - Manon Batista, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires  
10:10 - 10:50 Pause café  
10:50 - 12:30 Intégrité génomique et expression des gènes (Amphithéatre de la délagation du CNRS - Auvergne Rhône Alpes)  
10:50 - 11:15 › Intracellular dynamics of archaeal single-stranded DNA binding protein  
11:15 - 11:40 › Physical and functional interplay between PCNA and Mre11/Rad50 complex from Pyrococcus furiosus - Yang Lu, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes  
11:40 - 12:05 › Making Ribosomes in Archaea - Sébastien Ferreira-Cerca, Biochemistry III - Institute for Biochemistry, Genetics and Microbiology - University Regensburg  
12:05 - 12:30 › INTRODUCING AN OPPOSITE TWIST : CONSEQUENCE OF THE SIMULTANEOUS PRESENCE OF GYRASE AND REVERSE GYRASE ON THE ARCHAEAL CELL PHYSIOLOGY - Paul Villain, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule  
12:30 - 14:30 Déjeuner (Restaurant du CNRS)  
14:30 - 17:00 Table ronde - Prospective GdR